大连海事大学工程管理硕士专业学位硕士点于2010年开始招生，2020年根据《国务院学位委员会、教育部关于对工程专业学位类别进行调整的通知》（学位[2018]7号），学校航运经济与管理学院“工程管理”（代码：125601），“项目管理”（代码：125602），“工业工程与管理”（代码：125603）组成新的工程管理硕士（MEM）专业学位授权点。2022年5月本学位授权点获得全国工程管理专业学位研究生教育指导委员会和中国（双法）项目管理研究委员会的认可，成为“工程管理硕士专业学位与IPMP认证合作培养单位”，被授权为国际项目经理（IPMP）人才培养基地。
本学位授权点依托学科为管理科学与工程一级学科、是辽宁省重点学科。该学科目前有辽宁省物流航运管理系统工程重点实验室、辽宁省港口与物流枢纽数字化重点实验室、国家博士后流动站等学科基地，省级教学团队，海上运输跨专业综合实验实训平台、港航卓越人才培养的“盐田模式”校外实践教育基地等。本学科下设4个本科专业，其中物流管理、电子商务、信息管理与信息系统为国家级一流本科专业建设点，已构成从国家级一流本科到硕士、博士及博士后的多层次人才培养体系。
本学科现有师资50余人，其中博士生导师6人，硕士生导师44人，教授19人，博士51人。近年来，本学位授权点获省部级科技进步一等奖、省教学成果一等奖各1项、二等奖2项，省级技进步奖二等奖7项；市级科技进步奖一等奖1项；软件著作权30余项；培养省优博士论文1篇、省优硕士论文6篇；发表高质量学术论文300多篇，其中包括国际商科著名的UTD-24期刊INFORMS Journal on Computing、Production and Operations Management，获批国家级、省部级及以上项目100余项。